Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf1Q64213 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms