Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim24Q64127 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms