Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.1 ms