Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Sh3gl2Q62420 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Sh3gl2Q62420 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Sh3gl2Q62420 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Sh3gl2Q62420 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Sh3gl2Q62420 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3gl2Q62420 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms