Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sprr1bQ62267 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms