Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six3Q62233 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Six3Q62233 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Six3Q62233 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Six3Q62233 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Six3Q62233 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six3Q62233 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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