Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phox2aQ62066 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms