Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms