Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifi47Q61635 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifi47Q61635 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms