Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cd53Q61451 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cd53Q61451 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cd53Q61451 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cd53Q61451 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cd53Q61451 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cd53Q61451 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cd53Q61451 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cd53Q61451 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Cd53Q61451 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd53Q61451 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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