Protein–RNA interactions for Protein: Q61418

Clcn4, H(+)/Cl(-) exchange transporter 4, mousemouse

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn4Q61418 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Clcn4Q61418 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Clcn4Q61418 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Clcn4Q61418 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Clcn4Q61418 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Clcn4Q61418 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Clcn4Q61418 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Clcn4Q61418 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Clcn4Q61418 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Clcn4Q61418 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Clcn4Q61418 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcn4Q61418 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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