Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms