Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a1Q61165 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms