Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd6Q61003 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd6Q61003 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms