Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms