Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms