Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp7Q60973 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms