Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Laptm4aQ60961 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Laptm4aQ60961 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Laptm4aQ60961 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Laptm4aQ60961 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Laptm4aQ60961 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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