Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot7Q60809 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot7Q60809 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms