Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms