Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc27a1Q60714 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a1Q60714 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms