Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms