Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms