Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CttnQ60598 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms