Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms