Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabl6Q5U3K5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms