Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myh1Q5SX40 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms