Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Med13Q5SWW4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms