Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms