Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ssh2Q5SW75 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh2Q5SW75 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms