Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42Q5SV66 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms