Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms