Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms