Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh12Q5RJH3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms