Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm12253Q5NC48 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm12253Q5NC48 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm12253Q5NC48 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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