Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms