Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms