Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms