Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms