Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms