Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otol1Q4ZJM7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otol1Q4ZJM7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms