Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx33Q4VAA7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms