Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xirp2Q4U4S6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xirp2Q4U4S6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms