Protein–RNA interactions for Protein: Q4QY32

Gm6040, Beta-defensin 51, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6040Q4QY32 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm6040Q4QY32 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6040Q4QY32 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms