Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3lQ4KL14 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms