Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL04

Gm5168, Predicted gene 5168, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5168Q4KL04 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm5168Q4KL04 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm5168Q4KL04 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm5168Q4KL04 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm5168Q4KL04 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm5168Q4KL04 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm5168Q4KL04 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5168Q4KL04 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms