Protein–RNA interactions for Protein: Q499E6

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q499E6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1orf109Q499E6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf109Q499E6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms