Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms