Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Carmil2Q3V3V9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms