Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk4Q3V129 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms